Según informe presentado por ACM hay siete errores comunes de seguridad que se deben de evitar al tener un servidor en producción con Linux:

1. Eliminar las cuentas de usuarios no utilizadas.
2. Recursos insuficientes y mala determinación de prioridades.
3. Programas inseguros y mal configurados.
4. Utilizar software sin actualizar.
5. ejecución de servicios innecesarios.
6. Contraseñas débiles.
7. Procrastinación (acción de postergar actividades o situaciones hostiles).
   

Fuente:  ComuLinux